科屬區別：旗魚和劍魚都屬於鱸形目，但旗魚屬於旗魚科，劍魚則屬於劍魚科。背鰭區別：旗魚的背鰭更發達，是帆狀的。顏色區別：旗魚的顏色更多樣，劍魚的顏色一般是背部較暗、腹部較淺。體型區別：旗魚在成年後身體很少超過3米，劍魚有些品種的體型更大。速度區別：旗魚的魚鰭很發達，游泳速度更快一些。
旗魚和劍魚都是生活在海洋之中的魚類，而且都屬於硬骨魚。不過，二者並不是同一種魚，是不同的兩種魚，不能將二者混淆。它們在許多方面都是有差別的。
上面已經介紹過，旗魚和劍魚並不是同一種魚，可以從以下幾個方面來區分它們：
1、科屬區別：旗魚和劍魚都屬於硬骨魚綱和鱸形目，不過它們的科類是不同的。旗魚屬於旗魚科，劍魚則屬於劍魚科。
2、背鰭區別：從外觀上來看，旗魚和劍魚也有些不同之處。比如，它們的背鰭就是不同的。旗魚的背鰭十分發達，從外觀上來看是帆狀的，這也是它們得名的原因。它們的背鰭一直從頭部延伸到它們的尾巴，體積非常大。而劍魚的背鰭則比較小，並不是特別明顯，一般是三角狀的。
3、顏色區別：旗魚和劍魚的身體顏色是不同的。旗魚的身體顏色更多樣一樣，有些品種甚至由兩種比較鮮豔的顏色組成，是呈漸變分佈的。它們也會有一些鮮豔的顏色，比如紅色、紫色、黃色等。劍魚的顏色也一般是背部比較暗、腹部則稍微淺一些。
4、體型區別：旗魚和劍魚的體型也是不同的。從身體長度來看，旗魚在成年之後的長度很少可以超過3米。不過有些品種的劍魚體型很大，超過3米的比較多。
5、速度區別：旗魚和劍魚都屬於生活在海洋之中的、同時遊動速度非常快的魚類。不過，二者相比還是有速度更快的品種。具體來說，旗魚的肌肉更發達，而且具有發達的魚鰭，遊動速度會比劍魚更快。
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