看尾巴：若是公龜，尾巴會比較長，也比較粗；母龜的尾巴比較短小。看洩殖孔：公龜和母龜的洩殖孔位置有差異，公龜的洩殖孔距離腹甲的距離是比較遠的。看腹甲：觀察它們的腹甲，若是有凹陷，就是公龜。看生殖器官：公龜有時候會將陰莖露出來，可以從這個方面來區分公母。
大鱷龜比較小的時候很難區分它們的公母，至少要在它們的體重1公斤之上才能區分。具體來說，可以從以下幾個方面區別：
1、看尾巴：公龜和母龜的尾巴大小差異是比較大的。公龜的尾巴會比較長，也比較粗。母龜的尾巴則正好相反，是又粗又短的。
2、看洩殖孔：可以通過它們洩殖孔的位置來區分它們。如果是公龜，則它們的洩殖孔距離腹甲是比較遠的；母龜的洩殖孔則比較靠近它們的腹甲。
3、看腹甲：也可以直接觀察它們的腹甲，看上面有沒有凹陷進去的部分。如果有則是公龜，如果沒有則是母龜。
4、看生殖器官：還可以通過它們的生殖器官來判斷。公龜有時候會將它們的陰莖露出來，從這個特點就可以判斷公母。
大鱷龜的公龜和母龜可以放在一起養。從性格方面來看，大鱷龜都是比較膽小的，不太容易跟其它的龜起衝突，一般不會打架，在吃東西的時候也會在原地不動，基本不會出現搶食的情況。可以從它們比較小的時候就讓公龜和母龜生活在一起，這樣在它們成熟之後還可以嘗試繁殖。不過，若是混養的話，空間是一個需要注意的因素。大鱷龜的體型相對來說都是比較大的，因此混養的話一定要選擇一個大一些的容器。
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