蝴蝶鯉在成年之後比較容易區分公母。首先可以從體型來判斷，公魚的體型是比較細長的，母魚的體型則是比較豐滿的。還可以通過胸鰭來判斷，公魚的胸鰭比較尖，母魚的胸鰭則看起來比較圓。在繁殖期的時候，腹部大、生殖器外凸的是母魚。腹部正常、生殖器則凹陷的則是公魚。
蝴蝶鯉在處於幼魚階段的時候，區分公母是比較困難的。在它們成年之後，就可以區分公母了。具體來說，可以從以下三個方面進行區分：
1、體型：若是公魚和母魚的年齡基本一致，而且它們都成年了，則可以從它們的體型方面來進行區分。若是公魚，那麼它們的體型看起來會比較修長；若是母魚，那麼它們的體型則看起來比較豐滿。
2、外觀：公的蝴蝶鯉和母的蝴蝶鯉在外觀方面有比較大的差異。首先，從頭部來看，公魚的頭部與母魚相比會有突起的狀態，不過有時候不太容易觀察到。另外，它們的胸鰭也有一定的差異，公魚的胸鰭是比較尖的，而母魚的胸鰭看起來則是比較圓的。
3、繁殖期：若是公魚和母魚都處於繁殖期的話，那麼可以從兩個方面來區分。從腹部來看，若是腹部比較大的就是母魚。從生殖器來看，母魚的生殖器是外凸的，公魚的生殖器則是凹陷的。
蝴蝶鯉在拖尾之後，觀賞性會增強。一般來說，公的蝴蝶鯉和母的蝴蝶鯉都是可以拖尾的。它們拖尾的時候基本會在它們的身體長度長到20釐米時。不過，它們尾巴的大小是不太一定的，要想它們的尾巴大，需要注意營養以及環境等方面。
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