鸚鵡魚大致可以分為五種顏色。黃鸚鵡魚的顏色是黃色。白玉鸚鵡魚的顏色是白色，但是眼睛周圍有一條紅線。麒麟鸚鵡魚的顏色是紅色，但身上有白點。迷你鸚鵡魚的顏色一般都是藍白或純白色。最常見的血鸚鵡，顏色是紅色。鸚鵡魚還有很多通過後期人工改變的體色，但這種顏色不持久，很容易褪色。
鸚鵡魚主要有紅、黃、白、紅白、藍白等五種顏色，不同品種的鸚鵡魚體色是不同的：
1、紅色：紅色的鸚鵡魚是比較常見，也是數量較多的。主要品種有血鸚鵡魚、金剛鸚鵡魚、紅元寶鸚鵡魚、一顆心鸚鵡魚等。這幾種鸚鵡魚雖然體色都是紅色的，但是體型各異，所以被分成了不同的品種。
2、黃色：黃色的鸚鵡魚被稱為黃鸚鵡魚，也是常見的品種。但是黃鸚鵡魚不能喂增色飼料，不然就會變成紅色。
3、白色：白色的鸚鵡魚不太常見，一般只有迷你鸚鵡魚、白玉鸚鵡魚才會出現整體白色，尤其是白玉鸚鵡魚，渾身雪白，只有眼睛周圍有一圈紅色的線，非常美觀。
4、紅白色：麒麟鸚鵡魚和紅白鸚鵡魚，都是紅白色的。但是不同的是麒麟鸚鵡魚是紅底白點，紅白鸚鵡魚是紅白色塊拼接，並且有可能掉色，變成白玉鸚鵡魚。
5、藍白色：藍白色的代表品種就是迷你鸚鵡魚，身體是藍白相間的條紋。因為體型小巧、靈活，再加上藍白相間的條紋，非常具有觀賞性。
鸚鵡魚的種類很多，都是後期人工培育出來的，比較常見的有血鸚鵡魚、金剛鸚鵡魚、麒麟鸚鵡魚、一顆心鸚鵡魚、元寶鸚鵡魚、紅白鸚鵡魚等等。
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