看尾巴：可以看它們尾巴的尖端有沒有鱗片，有就是公龜，沒有則是母龜。還可以看尾巴的大小，尾巴粗大的是公龜，尾巴短小的是母龜。看洩殖孔位置：公龜的洩殖孔距離腹甲的邊緣是比較遠的，母龜的洩殖孔則距離腹甲邊緣比較近。看四肢：後肢上有粗糙鱗片的是公龜，沒有的則是母龜。
1、看尾巴：公紅面蛋龜和母紅面蛋龜的尾巴是有區別的。首先可以看它們尾巴的尖端有沒有鱗片。若是有比較明顯的鱗片，那麼就說明是公龜；如果沒有鱗片，那麼就是母龜。不過，若是公龜還沒有成熟，年齡還比較小的話，上面也是沒有鱗片的。再者，還可以通過尾巴的大小來區分公龜。若是公龜，那麼它們的尾巴相對來說就會粗大一些，母龜的尾巴則比較小。
2、看洩殖孔位置：可以觀察一下紅面蛋龜的洩殖孔位置。若是洩殖孔比較靠近腹甲的話，那麼就是母龜；如果洩殖孔距離腹甲的邊緣比較遠，那麼就說明是公龜。
3、看四肢：還可以觀察一下紅面蛋龜的四肢。若是它們的後肢上有粗糙的鱗片，那麼就是公龜；反之，若是沒有粗糙的鱗片，那麼就是母龜。不過，即使是公龜，若是它們還沒有成熟的話，那麼也有可能沒有鱗片，這一點在區分公龜的時候需要特別注意一下。
紅面蛋龜在比較小的時候，是無法區分公母的，因為此時公龜和母龜的區別特徵還不明顯。一般來說，養殖兩三天的紅面蛋龜才可以比較明確地區分出公母來。它們的體型普遍是比較小的。從體型方面來看，在其身體的長度達到將近10釐米的時候，就能開始區分公母了。不過具體來說紅面蛋龜的成熟時間是不一定的，會有個體差異。
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