體型區別：沼澤側頸龜更大一些，身體的長度在30-50釐米之間。西非側頸龜的身體長度則只有20釐米左右。腹甲顏色區別：沼澤側頸龜的腹甲顏色一般是棕色，比較深，而西非側頸龜的腹甲顏色比較淡。分佈地區區別：沼澤側頸龜主要分佈在非洲南部的國家，而西非側頸龜主要分佈在非洲西部的一些國家。
沼澤側頸龜和西非側頸龜都是熱帶的烏龜品種，不論是外觀，還是習性，這兩種烏龜都是比較類似的。不過，也有一些方面可以將它們區分開：
1、體型區別：沼澤側頸龜和西非側頸龜的體型有較大的差異。沼澤側頸龜的體型會大一些，它們在成年之後的身體長度會在30-50釐米之間；西非側頸龜的體型則比較小，它們的身體長度會在20釐米左右。不過這只是成年後的體型，而且若是從這個方面比較的話需要選擇兩隻年齡類似的龜。
2、腹甲顏色區別：二者的外觀雖然有一定的相似性，但它們腹甲的顏色是有區別的。西非側頸龜的腹甲顏色是比較淡的，它們的顏色一般是淡黃色或者白色。而沼澤側頸龜的腹甲顏色則比較深，在成年之後的顏色是棕色或者棕黑色的。雖然沼澤側頸龜在小的時候腹甲顏色較淡，但比較起來還是比西非側頸龜的深一些。
3、分佈地區區別：二者的分佈地區也有差異。西非側頸龜主要分佈在非洲西部的一些國家，比如安哥拉、剛果共和國等等，這也是它們得名的原因。而沼澤側頸龜則主要分佈在非洲南部的一些國家，以及馬達加斯加島。
沼澤側頸龜可以和西非側頸龜可以放在一起養，一般不會起衝突。不過，考慮到它們成年之後的體型還是比較大的，因此空間要充足才行。再者，餵食的時候也要注意，為了避免它們打架，需要分開餵食，並且提供充足的食物。
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